Содержание | Следующая статья | Предыдущая статья
Журнал 'Цитокины и воспаление', 2008, № 4
РАСПРЕДЕЛЕНИЕ ЧАСТОТ АЛЛЕЛЕЙ И ГЕНОТИПОВПОЛИМОРФНЫХ ЛОКУСОВ IL-1B, IL-1RN И IL-10 У ЧЕЛОВЕКА ПРИ ПЕРСИСТЕНЦИИ МИКОПЛАЗМ (MYCOPLASMA HOMINIS)
О.А. Чернова, Н.Б. Баранова, Н.И. Акберова, О.В. Горшков, А.А. Музыкантов, В.М. Чернов
Целью работы явилось выяснение особенностей распределения частот аллелей и генотипов IL-1B-511C?"?T, IL-1B?+?3954С?"?Т, IL-1RN (VNTR) и IL-10-1082G?"?A в группах инфицированных M. hominis и не инфицированных микоплазмами индивидов - жителей г. Казани. В качестве материала исследования были использованы образцы ДНК индивидов, обследовавшихся в акушерско-гинекологическом центре (ООО "Здоровье семьи", г. Казань). Генотипирование IL-1 и IL-10 в клинических образцах 378 индивидов осуществляли с помощью ПЦР, а также ПДРФ. В группе инфицированных M. hominis обнаружена повышенная частота встречаемости аллеля IL-1B?+?3954*С, генотипа IL-1B?+?3954С/С, а также генотипа IL-10-1082G/G. Достоверные различия в распределении частот аллелей и генотипов IL-1B-511C?"?T, IL-1RN (VNTR) в обследованных группах не выявлены. Согласно результатам расчетов, носительство аллеля IL-1B?+?3954*С (OR = 1,59; 95?% CI = 1,04-2,40) и генотипа IL-1B?+?3954С/С (OR = 1,80; 95?%CI = 1,09-2,96), а также генотипа IL-10-1082G/G (OR = 4,02; 95?% CI = 1,29-12,53) является фактором риска персистенции M. hominis в организме человека - микоплазмы, способной обусловливать развитие у человека ряда инфекционных и экстрагенитальных заболеваний, вызывать серьезные осложнения беременности, патологию и гибель плода. (Цитокины и воспаление. 2008. Т. 7, № 4. С. 11-14.)
Большой интерес к исследованию молекулярно-генетических факторов предрасположенности к микоплазменным инфекциям связан, с одной стороны, с уникальностью механизмов взаимодей-ствия мельчайших прокариот и высших эукариот, а с другой - диктуется практической необходимостью. Микоплазмы - возбудители персистентных инфекций, обусловливающих в организме человека дегенеративные процессы. Эти инфекции широко распространены у лиц детородного возраста; они передаются как горизонтальным - контактным, так вертикальным - от матери к плоду - путями [2]. Одной из наиболее распространенных мико-плазм, инфицирующих человека, является M. hominis. Ограниченные биосинтетические воз-можности этой микоплазмы не являются препятствием для ее распространения в различных микробиоценозах, инвазивности и персистенции в клетках разных тканей организма человека. Персистенция M. hominis может вызывать развитие как урогенитальных, так и экстрагенитальных инфекций инаппарантного типа (с отсутствием выраженных воспалительных реакций), обусловливающих серьезны е осложнения беременности, патологию и гибель плода [2, 13]. Контроль микоплазм представляет проблему, решение которой связывают с исследованиями "генных сетей", определяющих формирование системы "паразит-хозяин" [1]. В этой связи определение молекулярно-генетических маркеров предрасположенности и устойчивости к персистенции микоплазм является весьма актуальным как для фундаментальных исследований, так и практических разработок средств контроля: лечения и профилактики микоплазменных инфекции. Однако в этом направлении сделаны лишь первые шаги [2].
Предполагают, что предрасположенность и устойчивость к персистенции микоплазм, как и ряда других микроорганизмов, у человека может быть связана с наличием у индивидов определенных вариантов полиморфных локусов генов IL-1 и IL?10 - ключевых иммуномедиаторов, определяющих активацию и ингибицию иммунного ответа [5, 9, 15].
Диаллельный полиморфизм IL-1B-511C?"?T, IL-1B?+?3954С?"?Т, IL-10-1082G?"?A, связанный с заменами нуклеотидов в соответствующих позициях последовательностей генов, относится к типу SNP (single nucleotide polymorphism) [8, 14]. Полиморфизм IL-1RN, связанный с вариабельностью 86-членных тандемных повторов во втором интроне гена, относится к типу VNTR (variable number of tandem repeat) и предполагает существование пяти аллелей, наиболее значимыми из которых считают аллель 2 (IL-1RN*2), и, в меньшей степени, аллель 1 (IL-1RN*1), а также аллель 3 (IL-1RN*3) [8].
Ассоциация полиморфизма генов про- и противовоспалительных цитокинов, определяющих баланс "активации-ингибиции" иммунореактивности и восприимчивости к инфекционным заболеваниям, в настоящее время интенсивно исследуется в различных регионах мира. Показано, что существуют выраженные этнические различия в распределении частот аллелей и генотипов полиморфных вариантов интерлейкинов 1 и 10, но восприимчивость к персистенции патогенных микроорганизмов в разных этногеографических группах ассоциирует с наличием у индивидов конкретных аллелей и генотипов полиморфных локусов IL-1, IL-10, определяющих активацию и подавление иммунного ответа [5-9, 11, 12]. Сообщения о соответствующих исследованиях в отношении M. hominis отсутствуют. В связи с этим целью нашей работы явилось выяснение особенностей распределения частот аллелей и генотипов IL-1B-511C?"?T, IL-1B?+?3954С?"?Т, IL-1RN (VNTR) и IL-10-1082G?"?A в группах инфицированных M. hominis и не инфицированных микоплазмами индивидов - жителей г. Казани.
Материалы и методы
В качестве материала исследования были использованы образцы ДНК индивидов, обследовавшихся в акушерско-гине-кологическом центре (ООО "Здоровье семьи", г. Казань). Среднийвозраст пациентов составлял 29,03?+?8,43 года. Все обследуемые индивиды принадлежали к одной географической группе - жители г. Казани. В отношении этнической принадлежности группа больных и группа контроля были смешанными. Выделение образцов ДНК проводили с использованием коммерческого набора "ДНК-сорб-А" ("АмплиСенс", Россия). Для выявления M. homi-nis в клиническом материале (мазки урогенитального тракта) использовали коммерческий набор "ПОЛИМИК-Мк" (НПФ "Литех", Россия). Генотипирование IL-1 и IL-10 в клинических образцах 378 индивидов осуществляли с помощью ПЦР, а также ПДРФ [7, 8, 10]. Праймеры для амплификации нуклеотидных последовательностей соответствующих генов были синтезированы в НПФ "Литех" (Россия). Амплификацию полиморфных локусов IL-1B-511C?"?T,IL-1B?+?3954С?"?Т, IL-1RN (VNTR) и IL-10-1082G?"?A выполняли согласно [7, 8, 10]. Рестрикцию ампликонов полиморфных локусов IL-1B проводили с использованием эндонуклеаз AvaI и TaqI ("Fermentas", Литва) [8]. Электрофоретическое разделение фрагментов ДНК проводили в 2?%-ном геле агарозы ("Хеликон", Россия) при напряженности электрического поля 5-8 В/см. Анализ ампликонов осуществляли с помощью видеосистемы для регистрации гелей "DNA Analyzer" (НПФ "Литех", Россия).
Статистическую обработку данных выполняли с использованием программного обеспечения MS Excel (Microsoft). При сравнении частот генотипов и аллелей в группах инфицированных и не инфицированных M. hominis лиц использовался критерий ?2 (p) с поправкой Йейтса на непрерывность. Для сравнения значений меньше пяти использовали двухсторонний критерий Фишера. Силу ассоциаций оценивали в значениях показателя отношения шансов (OR), а также рассчитывали его 95?%-ный доверительный интервал (95?% CI).
Читайте статью целиком
в печатной версии журнала!
Содержание | Следующая статья | Предыдущая статья
|
Подпишитесь на журнал "Цитокины и Воспаление" он-лайн!

Начата подписка на 2011 год!

Обновление на книжной полке: компакт-диск Цитокины и воспаление, 2008 год.
|